《古易音训》二卷，又名“周易音训”，系门人金华王莘叟所笔受，书甫毕而东莱病殁，故系东莱晚期之作。本书是东莱在考正《周易》的编次而作《古周易》的基础上，又进而考正《周易》的文字音义的著作。他汇纂陆德明《经典释文》和晁说之《古周易》而成此书，内容可谓翔实丰富。今传世诸本《易释文》多有舛误，唯此编所载与宋抄本合。晁说之生于北宋，犹见郑玄《周易注》四篇以及唐代诸家之说，其书吸收了许多今已失传的宋代以前的资料。然而晁氏的《古周易》今亦失传，全赖东莱此书以存其梗概，即此可见该书之价值。朱子注释群经，悉有音训，唯作《周易本义》，因有东莱此书而音训独阙，故其子朱鉴取此书与《本义》合刊行世。
《易说》二卷，乃东莱门人所记师说，由弟祖俭辑录，又经祖俭之子乔年补缀编次成书。故收入《丽泽论说集录》时题名“门人集录易说”，而收入文集及其他丛书者皆径题“易说”。《易说》是东莱在继承程子《易传》所阐释的义理基础上，进一步发挥易理的讲学记录。但因系出众门人所记，而非东莱亲手著述，故全书内容缺少完整性和系统性；而且各卦详略不等，或多达上千字，或少仅数十字，甚至有十八卦内容全缺。然其所论见解精辟而多卓识，且能时出新意，堪称《易》学义理派的上乘之作，故在学术史上有其较大的影响。
《周易系辞精义》二卷，是东莱有鉴于程子所作《周易程氏传》只解六十四卦经文而不解《大传》，故集周、张、二程诸家经说、语录及二程门人共十四家之说为此书以补其阙。当时朱子即对此书有所评论，认为此书“编得亦杂，只是前辈说话有一二句与《系辞》相杂者皆载”，“这文字虽然是裒集得做一处，其实于本文经旨多有难通者”云云。尽管朱子认为此书在取舍上未臻精当，但也即此可见此书在收集资料方面确乎丰富而全面，更可藉以证明此书确为东莱所编殆无疑义。然而陈振孙《直斋书录解题》则引《馆阁书目》以为托祖谦之名，以致后人多沿其说，对此实有辨正之必要。本书内容虽然比较庞杂，但能广集诸家之说于一书，确实给研究《周易》提供了方便；其中尤其对于《周易程氏传》曾取尹氏本和朱子本参定其异同，又从小学家是正其文字，用力至深；而其中所载如《龟山易说》等书久已失传，而此书为之保存了不少翔实的资料。因而此书仍不失为一本有重大价值的书。
《读易纪闻》一卷，乃东莱读《易》时所记下的心得体会，共六十六条，多为独具卓识的精辟见解。
《古周易》、《古易音训》、《易说》、《周易系辞精义》与《读易纪闻》同为东莱的重要易学著作。《古周易》在于考正恢复《周易》古本的编次，《古易音训》即根据《古周易》的编次而进行文字考正，《易说》和《周易系辞精义》则在前两书的基础上分别发挥《周易》经、传的义理，而《读易纪闻》则是随时所录的读《易》札记。五书共同组成东莱自成体系的《易》学系统。
《书说》十卷，据《直斋书录解题》的说法，认为“其始为之也，虑不克终篇，故自《秦誓》以上，逆为之说，然说仅能至《洛诰》而止”。这是说，东莱在开始撰写此书之初，就已担心自己生前可能来不及完成，才从最后一篇《秦誓》开始，从后向前逆写，只写到《洛诰》而止，故《书说》是一部未写完的书。其实，东莱的《书说》乃继其师林少颖《书集解》而作。因林氏《书集解》至《洛诰》而止，故东莱《书说》始《洛诰》而终《秦誓》，凡十八篇，以补师说之未及。盖林少颖受学于东莱之伯祖吕居仁，东莱又受学于少颖，本以终始其师说为一家之学也。
《吕氏家塾读诗记》三十二卷，卷一为总论，分《纲领》、《诗乐》、《删次》、《大小序》、《六义》、《风雅颂》、《章句音韵》、《卷帙》、《训诂传授》、《条例》等项，卷二以下始分篇释《诗经》本文及《大小序》。其书汇集自毛、郑以来八十多家《诗》说，存其名氏；先列训诂，后陈诗义；剪裁贯穿，如出一手；己意有所发明，则别出之。朱子为之作《序》，谓其“兼总众说，巨细不遗，挈领提纲，首尾该贯，既足以息夫同异之争；而其述作之体，则虽融会通彻浑然若出于一家之言；而一字之训、一事之义，亦未尝不谨其说之所自；及其断以己意，虽或超然出于前人意虑之表，而谦让退托，未尝敢有轻议前人之心也”。本书大体上持论公允、通达，择善而从，并不碍于成说或偏见，总的特点是“兼总众说，巨细不遗，挈领提纲，首尾该贯”，这也突出地反映出东莱学术上博采兼综、不存门户之见的风格。正如陈振孙《直斋书录解题》所谓“诗学之详正，未有逾于此书者”。东莱此书还在一定程度上纠正了宋人力诋《毛传》、《郑笺》，以己意解经之弊，这是应该肯定的；但他坚守毛、郑，信从《小序》，以为得其真，则又未免成为此书的局限。此书大致在淳熙元年居丧期间写成初稿，又于淳熙三年、六年复加修订，以期修成正稿。遗憾的是直到东莱逝世前两日，才修订到《公刘》一章为止，未能最后修订完成。尤袤作《跋》谓东莱一生“六经皆有论著，未就，独此书粗备”。今从东莱的《吕氏家塾读诗记》与朱子的《诗集传》两部《诗》学名著的内容看来，前者是对《诗》学旧说的全面总结，而后者则是对《诗》学新说的大胆开拓。两书观点不同，然而各有千秋。
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